脑发育迟缓的原因多种多样，其实核黄疸属于一种非常常见的脑发育迟缓的原因：是脑发育迟缓不会坐的重要因素，但现在由于围产医学进步，核黄疸引起的脑瘫比例下降。

脑发育迟缓的原因包括脑缺氧缺血：故凡能造成母体与胎儿间血液循环和气体交换障碍，或导致新生儿动脉低血压、静脉淤血者，均有可能引起脑缺血缺氧，造成大脑损伤而遗留脑瘫。

脑发育迟缓的原因包括低体重儿：包括早产未成熟儿，足月小样儿。这些婴儿均不同程度宫内发育迟缓。同时也影响中枢神经系统发育，且常并发室管膜下出血和脑室内出血，后者易引起痉挛性两侧瘫，易导致脑发育迟缓不会坐。

脑发育迟缓的原因还有先天性异常因素，包括各种原因引起的脑发育异常，如神经管闭合不全致先天性脑积水、脑泡演化发育障碍所致的全前脑及神经组织移行障碍所致的平脑回畸形，巨脑回畸形以及小多脑回等，包括联合障碍所致的透明隔缺如或发育不全。